Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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