Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms