Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atxn3Q9CVD2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atxn3Q9CVD2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atxn3Q9CVD2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atxn3Q9CVD2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atxn3Q9CVD2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atxn3Q9CVD2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atxn3Q9CVD2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn3Q9CVD2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms