Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms