Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms