Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Derl1Q99J56 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Derl1Q99J56 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Derl1Q99J56 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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