Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.6 ms