Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39cQ8VE09 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms