Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PpcsQ8VDG5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms