Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc178Q8CDV0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc178Q8CDV0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc178Q8CDV0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc178Q8CDV0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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