Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin52Q8CD94 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lin52Q8CD94 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Lin52Q8CD94 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lin52Q8CD94 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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