Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms