Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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