Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan12Q8BKT6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms