Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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