Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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