Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms