Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne3Q4FZC9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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