Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Chpf2Q3UU43 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Chpf2Q3UU43 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Chpf2Q3UU43 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Chpf2Q3UU43 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Chpf2Q3UU43 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Chpf2Q3UU43 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chpf2Q3UU43 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms