Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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