Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Skap2Q3UND0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms