Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms