Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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