Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms