Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms