Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms