Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl1bQ0MW30 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms