Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms