Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms