Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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