Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nedd1P33215 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nedd1P33215 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nedd1P33215 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nedd1P33215 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nedd1P33215 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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