Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxrgP28705 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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RxrgP28705 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RxrgP28705 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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RxrgP28705 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxrgP28705 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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