Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnna1P26231 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms