Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sdc1P18828 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sdc1P18828 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sdc1P18828 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sdc1P18828 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sdc1P18828 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sdc1P18828 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sdc1P18828 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms