Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18529 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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P18529 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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P18529 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18529 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18529 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms