Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms