Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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