Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcn2O88968 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tcn2O88968 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms