Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Opn1mwO35599 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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