Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm4340L7N2C4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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