Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm3542K7N6U2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm3542K7N6U2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm3542K7N6U2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm3542K7N6U2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm3542K7N6U2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm3542K7N6U2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm3542K7N6U2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3542K7N6U2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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