Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms