Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms