Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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