Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms