Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms