Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms