Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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