Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Apobec2Q9WV35 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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