Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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